Ф.Ф.Рыбаков в 1969 году окончил Ленинградский государственный университет им. А.А.Жданова и был оставлен в аспирантуре. Его кандидатская диссертация «Исследование затрат и результатов деятельности отраслевых научно-технических организаций», успешно защищенная в 1973 году, легла в основу пионерного спецкурса. Он продолжил преподавательскую деятельность на экономическом факультете ЛГУ в должности ассистента кафедры экономики исследований и разработок, затем доцента кафедры политической экономии для гуманитарных факультетов (1973-1986 годы). В 1987 году Ф.Ф.Рыбаков успешно защитил докторскую диссертацию на тему «Политико-экономические проблемы формирования и развития научно-производственных комплексов», где выдвинул оригинальные идеи совершенствования товарно-денежных отношений в сфере научно-технического процесса. С 1986 года был направлен на заведование кафедрой в Ленинградский государственный институт культуры им. Н.К.Крупской. С 1991 по 1993 годы был проректором по научной работе ЛГИК. В 1993 - 1995 годы - профессор СПбГУ, а с 1996 по июнь 2011 года - заведующий кафедрой экономической теории и экономической политики СПбГУ.
Ф.Ф. Рыбаков является автором более 430 научных работ, в том числе 17 монографий (10 индивидуальных). Ряд работ издан в США, Великобритании, Германии, Финляндии. Его труды печатались в издательствах «Мысль», «Наука», «Лениздат», «Гидрометеоиздат», «ЛГУ». Сфера научных интересов – экономика Санкт-Петербурга и Северо-Запада России. В 2004 году за цикл работ по экономике Санкт-Петербурга и Северо-Запада удостоен премии СПбГУ I степени «За научные труды». В 2011 году в издательстве «Наука» вышла в свет очередная монография. Статьи Ф.Ф. Рыбакова публикуются в ведущих российских экономических журналах («Вопросы экономики», «Российский экономический журнал», «Экономист», «Инновации», «Вестник СПбГУ» и др.). Профессор Ф.Ф. Рыбаков является членом совета по защите докторских диссертаций, членом редколлегии журналов «Вестник СПбГУ» (серия: экономика), «Проблемы современной экономики», в течение 8 лет был членом экспертного совета ВАК РФ, был председателем совета по защите докторских диссертаций. В течение всей профессиональной деятельности Ф.Ф.Рыбаков исследовал экономику Ленинграда-Санкт-Петербурга, неоднократно привлекался в качестве эксперта и консультанта при разработке проектов социально-экономического развития Санкт-Петербурга и Ленинградской области.
Профессор Ф.Ф.Рыбаков впервые подготовил и прочитал авторские курсы «Экономический анализ деятельности научных организаций» (1973 год), «Экономика Санкт-Петербургского региона» (1997 год), «Экономические реформы в России: история и современность» (1991 год). В 1993 году Ф.Ф.Рыбаков подготовил спецкурс «Экономика социально-культурной сферы», который читается на экономическом факультете.
Ф.Ф. Рыбаков обладает энциклопедическими знаниями и глубокой эрудицией. Его лекции пользуются неизменным интересом студенческой аудитории. В 2009 году он был удостоен премии СПбГУ «За педагогическое мастерство». Яркий и увлекающийся человек, Ф.Ф. Рыбаков формирует вокруг себя творческую атмосферу. Под его редакцией опубликовано 6 монографий и 14 сборников научных статей. Подготовил 10 докторов и 32 кандидата наук. Строгая научная принципиальность и требовательность Ф.Ф.Рыбакова сочетаются с деликатностью и корректностью во взаимоотношениях с коллегами. Он пользуется заслуженным авторитетом студентов и преподавателей СПбГУ.