Сотрудники МРЦ обеспечивают работоспособность имеющегося оборудования и выполняют сбор данных по проектам МРЦ, инициируемых уполномоченными представителями факультетов СПбГУ, согласно утвержденному регламенту.  Эта деятельность финансируется из централизованных средств СПбГУ, что обеспечивает возможность выполнения проектов МРЦ  на безвозмездной основе.

        Помимо основной деятельности ведущие специалисты МРЦ могут проводить научные исследования и учебные занятия со студентами и аспирантами. Научные исследования проводятся в рамках внутривузовского совместительства по научным проектам, выполняемых факультетами СПбГУ. Учебные занятия проводятся на условиях почасовой оплаты. 

      МРЦ по направлению "Нанотехнологии" расположен в здании НИИ Физики физического факультета CПбГУ в Старом Петергофе.