Собранная самим ученым, библиотека Д.И.Менделеева отражает его научные, общественно-политические и эстетические интересы. Многочисленные записи на полях и на свободных листах книг ставят менделеевскую библиотеку в один ряд с архивными материалами. Большинство томов переплетено по указанию самого Менделеева. Это - сборники небольших книжек, оттисков статей, брошюр, на корешке переплета которых указана общая тематика статей тома, год издания, номер тома по каталогу и инициалы "Д. М.". Bнутри тома приводится сделанный Д.И. Менделеевым перечень названий статей, находящихся в томе. Для своей библиотеки Менделееевым были составлены каталоги - именной и тематический. По тематике книги в основном относятся к естествознанию и, в первую очередь, к химии. Обширно также собрание работ, посвященных развитию производительных сил России. Многие статьи и книги снабжены дарственными надписями Менделееву. Особое место занимает собрание сочинений Д.И. Менделеева, составленное самим автором, куда включены и некоторые его рукописи, портреты и чертежи.